Tienen su origen en la Reforma. Son calvinistas en su doctrina, de espíritu puritano y conservador. Aparecen en el siglo XVI en Inglaterra como reacción contra el sistema uniforme de las parroquias territoriales impuesto por la Iglesia de Inglaterra bajo Isabel I. Al ser perseguidos, pasaron a Holanda, y alcanzó su máxima difusión en EE.UU. por los padres peregrinos (pilgrim fathers), en el que dieron origen a la rama Congregacionalista Americana. Insistían en el hecho de que la Iglesia es una comunidad local de cristianos que habían tenido la experiencia de la conversión a Cristo y que se reúnen libremente bajo el impulso del Espíritu Santo.

    Con ello se quiere volver a la primitiva organización de la Iglesia. Cada congregación (iglesia) es independiente y autónoma. La pertenencia a la Iglesia se vive en el ámbito local y uno no puede ser un auténtico cristiano sin formar parte de una Iglesia: Una  característica suya es: la incorporación al elemento laico de hombres y mujeres en las predicaciones. Los congregacionalistas ingleses son ahora parte de la United Reform Church. La mayoría de los congregacionalistas americanos pertenecen a la Iglesia Unida de Cristo. Son 1.600.000 adeptos (1980) .